ไวรัสชิคุนกุนยาจะถูกส่งต่อไปยังมนุษย์เมื่อยุงที่ติดเชื้อกัดจะทำให้ผิวหนังแตกและนำไวรัสเข้าสู่ร่างกาย การเกิดโรคของการติดเชื้อชิคุนกุนยาในคนยังไม่เป็นที่เข้าใจแม้ว่าจะมีการระบาดเมื่อไม่นานมานี้ก็ตาม ปรากฏว่าในหลอดทดลองไวรัสชิคุนกุนยาสามารถแพร่พันธุ์ในเซลล์เยื่อบุผิวและ บุ ผนัง หลอดเลือดของมนุษย์ ไฟโบรบลาส ต์ปฐมภูมิและแมคโครฟาจ ที่ได้ มา จากโมโนไซต์ การจำลองแบบของไวรัสเป็น ไซโตพาทิกสูงแต่ไวต่ออินเตอร์เฟอรอน ชนิด I และ ในร่างกาย ในการศึกษาโดยใช้เซลล์ที่มีชีวิต ไวรัส ชิคุนกุนยา ดูเหมือนจะทำซ้ำในเซลล์ไฟโบรบลาสต์ เซลล์ต้นกำเนิดของกล้ามเนื้อโครงร่าง และเส้นใยไมโอฟิ การตอบสนองของอินเตอร์เฟอรอนประเภทที่ 1 ดูเหมือนจะมีบทบาทสำคัญในการตอบสนองของโฮสต์ต่อการติดเชื้อชิคุนกุนยา เมื่อติดเชื้อชิคุนกุนยา ไฟโบรบลาสต์ของโฮสต์จะสร้างอินเตอร์เฟ อรอนอัลฟ่าและเบต้าชนิดที่ 1 ( IFN-αและIFN-β ) ในการศึกษาในหนู การขาด INF-1 ในหนูที่สัมผัสกับไวรัสทำให้เกิดการเจ็บป่วยและการตายเพิ่มขึ้น ส่วนประกอบต้นน้ำเฉพาะของ chikungunya ของวิถี interferon type-1 ที่เกี่ยวข้องกับการตอบสนองของโฮสต์ต่อการติดเชื้อ chikungunya ยังไม่ทราบ อย่างไรก็ตาม การศึกษาด้วยเมาส์แนะนำว่าIPS-1เป็นปัจจัยสำคัญและนั่นIRF3และIRF7มีความสำคัญในลักษณะที่ขึ้นกับอายุ